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单细胞测序技术的意义: 在基因水平,基因组本身就存在多态性,各种突变、重组会引起不同细胞间基因组序 列上的差异;此外,甲基化、乙酰化等表观遗传修饰上的差异也会引起细胞间基因表 达上的不同;在转录水平,不同的细胞内转录调节蛋白的种类和活性各不相同,许多 基因的转录还具有一定的随机性。 10X Genomics单细胞测序的优点: l0X Genomics单细胞转录组测序,是在单个细胞水平对mRNA进行高通量测序的一 项新技术,其能够以高通量和单分子分辨率研究单个细胞表达谱,揭示复杂细胞群体 的异质性,避免单个细胞的基因表达信号被群体的平均化所掩盖。10X Genomics系统具有高通量、周期短、适用范围广等优勢,一个样品可进行1000-10000个细胞转录组分析;6.5 min可完成上万细胞的封装,一天内完成单细胞捕获、反转录扩增与建库;相较其他平台,单个细胞的测序成本低;适用于绝大部分的细胞类型,包括生殖细胞、胚胎细胞、血细胞、神经细胞、肿瘤细胞、免疫细胞、干细胞等。 分析内容: 1. 测序数据统计与评估 2. 单细群分纳分类结果可视化 3. 亚群上调表达基因分析 4. 标记基因筛选以及调控网络分析 5. 定制化信息分析:已知标记基因表达分布 |